تفاوت پروفايل ژنتيكي سويه‌هاي در گردش در جامعه با سويه‌هاي واكسن سياه‌سرفه از يك سو و تلاش براي تهيه واكسنهاي كارامد بر اساس واكسنهاي زنده ضعيف شده از سوي ديگر، ما را بر آن داشت تا در اين تحقيق، بر اساس نتايج تحقيقات اپيدميولوژي در ايران، از سويه‌هاي بوردتلا پرتوسيس بومي كشور با پروفايل غالب ژنتيكي در تهيه سويه زنده ضعيف شده بر اساس ايجاد جهش در ژن ptxS1 استفاده شود. لذا ابتدا بر اساس پروفايل غالب ژنومي و ويرولانس سويه‌هاي بوردتلا پرتوسيس در گردش در جامعه، يك سويه بومي جدا شده از نمونه هاي باليني انتخاب شده و پس از موتاسيونهاي مربوطه در ژن ptxS1 و غيرفعال سازي آن، سازه‌اي مشابه با توالي ژن ptxS1 و قطعات فرادست و فرودست آن در وكتور مناسب ساخته شد. سپس بر اساس واكنشهاي كانجوگاسيون و نوتركيبي همولوگ ، ژن ptxS1 موتانت جايگزين ژن اصلي در سويه انتخابي شد. پس از ساخت سويه موتانت ضعيف شده، بيان ژن موتانت و كاهش توكسيسيته توكسين PTX بررسي و در نهايت ايمني زايي سويه موتانت در مدلهاي موشي مورد مطالعه قرار گرفت. با استفاده از نتايج اين مطالعه كه در واقع ساخت سويه موتانت در ژن ptxS1 بر اساس سويه بومي ايران با پروفايل ژنومي و ويرولانس غالب بود، همزمان با مطالعات انجام شده در كشورهاي توسعه يافته، گامي اوليه و مهمي در جهت تهيه واكسنهاي زنده ضعيف شده سياه‌سرفه، برداشته شد.